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如何将rna-seq的数据提交到ncbi中geo
1、对你所投序列所属物种分类(拉丁名)要有所了解,这通常是出错的地方(seqin)在你投递序列到发表文章之间,要注意NCBI发给你的电子邮件,它会询问你在什么时间将序列公布。具体细节你可以浏览参考资料所指连接。
2、Sample, Platform 和 Series是由作者上传的数据,dataset是由GEO官方从做和提交的数据整理出来的。1 Platforms GEO 号:GPLxxx。 芯片的组成信息,例如 cDNAs, oligonucleotide probesets, ORFs, antibodies 。
3、打开NCBI,点击Submit,然后会被导航到新的页面。选择提交的数据库。往下滑动的过程中,选择参考基因组进行数据提交,点击Submit即可。登录。
4、建议先用转录组序列从头组装(推荐trinity),再把从头组装的序列作为参考转录本,将RNA-SEQ数据比对到从头组装的序列中。或者把从头组装的序列和对应物种的NCBI unigene的序列整合在一起,去冗余之后再作为参考转录本。
雷达rna是什么币
1、RNA 币是雷达系统 DeFi 生态项目 GeneChain 中新增的一个币种。 GeneChain 是去中心化的高效安全公链,在支持高性能交易的基础上完成智能合约的兼容。
2、雷达 RNA 币 其实就 统 DeFi 生态项目 GeneChain 中 新研发的一款新 币种。 GeneChain 是一个去中心化的高效安全公链,主要是在性能方面更加的强大,可以在保证交易的基础上 , 也能实现智能合约的金融。
3、它与biteb一样,全是一种数字货币,应用了一种程序执行的源码,应用了区块链应用来发售贷币。雷达币2021年涨幅丰厚。可以看2020年3月份雷达币价钱的涨幅。二个月净收入:1月1号,面值1010RMB。
rna-seq的数据怎么放到论文里
首先下载个文件转换器。其次用软件把测序结果存成图片形式 。最后将图片插入到论文里面即可。
首先建立一个meta file,即包含实验信息的文件 将测序的fastq(*.fq或*.fastq)文件准备好,此为原始数据(必须)。
转录组数据在论文里要放的序列有:原始序列、清洗后的序列、拼接后的序列。原始序列:包括测序平台产生的原始序列数据,可以存放在公共数据库中,如NCBISRA,ENA等。需要提供测序的ID号、库名、测序平台、测序长度等信息。
RNA-seq数据分析是一个复杂的过程,主要分为以下步骤:数据质量控制:检查原始测序数据的质量,去除低质量的读段(reads)。序列比对:将质量控制后的读段与参考基因组或转录本数据库比对,以确定它们的位置。
建议先用转录组序列从头组装(推荐trinity),再把从头组装的序列作为参考转录本,将RNA-SEQ数据比对到从头组装的序列中。或者把从头组装的序列和对应物种的NCBI unigene的序列整合在一起,去冗余之后再作为参考转录本。
如何将rna-seq的数据提交到ncbi中geo?
1、https:// ,点击“ Register for a NCBI account”,进入到注册页面,如实填写信息。
2、对你所投序列所属物种分类(拉丁名)要有所了解,这通常是出错的地方(seqin)在你投递序列到发表文章之间,要注意NCBI发给你的电子邮件,它会询问你在什么时间将序列公布。具体细节你可以浏览参考资料所指连接。
3、如基于芯片数据(mRNA、DNA、蛋白丰度),蛋白质质谱数据和高通量测序数据。 GEO数据主要有4种基本类型。Sample, Platform 和 Series是由作者上传的数据,dataset是由GEO官方从做和提交的数据整理出来的。
4、打开NCBI,点击Submit,然后会被导航到新的页面。选择提交的数据库。往下滑动的过程中,选择参考基因组进行数据提交,点击Submit即可。登录。
5、建议先用转录组序列从头组装(推荐trinity),再把从头组装的序列作为参考转录本,将RNA-SEQ数据比对到从头组装的序列中。或者把从头组装的序列和对应物种的NCBI unigene的序列整合在一起,去冗余之后再作为参考转录本。
6、RNA-seq的测序数据要向NCBI提交,这里简单总结一下。
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